根据国务院学位委员会文件(学位[2011]69号)《关于下达“服务国家特殊需求人才培养项目”——学士学位授予单位开展培养硕士专业学位研究生试点工作单位名单的通知》精神，我校获批的工程硕士专业交通运输工程及船舶与海洋工程的六个方向，即车船运行安全与节能环保、港航路桥及隧道工程、海洋运输与物流工程、船舶与海洋结构物设计制造、船舶电子电气与轮机工程、游艇邮轮工程将于2011年10月份开始面向社会招生。
交通运输工程招生对象为本科毕业生和在职工程技术管理人员，学习方式为全日制，学制2.5年，每个专业方向招生人数为3—4人。在符合国家统一招生政策前提下，学生录取复试环节取消传统的具体课程考试科目，采用面试方式。面试内容可根据不同的考生类型、工程背景确定。对于应届本科毕业生结合其毕业设计（论文）重点考核专业应用能力；对于在职工程技术管理人员围绕其承担的工程项目，重点考核其专业素质及解决工程专项技术能力。面试教师由校内、校外导师组成，对于订单培养的研究生，加大用人单位面试考核的力度。培养体系采取建立课堂教学、现场学习实践、工程项目技能应用相互衔接的“三位一体”新型人才培养体系。
船舶与海洋工程招生对象为相关领域的应届本科毕业生与往届毕业生，领域内企业委托培养生，也针对相关企业进行订单式培养，学习方式为全日制学制2.5年，每个专业方向招生人数为3—4人。根据专业学位研究生选拔和培养特点，侧重对专业知识应用、专业能力倾向以及对考生科研动手能力和实践经验等方面的考查，应届生主要考核专业外语应用水平、基本识图能力和计算机绘图软件应用能力，不同方向考核内容不同；往届生侧重考核专业外语应用水平、生产实践能力，由联合培养单位进行考查。企业委托培养生：重点由联合培养单位考察其项目实施能力。此外，还将对考生兴趣、爱好、特长以及就业意向等方面进行考查。其中，有相关职业资格证书（船员适任证书等）者、有发明专利者、各种技能大赛获奖者优先录取。船舶与海洋结构物设计制造方向主要从事船舶设计制造；船舶电子电气及轮机工程方向主要从事船舶电气系统设计与安装、机舱自动化设计与调试和轮机管理；游艇邮轮工程方向主要从事造型与内装设计及艇体制造。
作为服务国家特殊需求人才培养项目，我校在培养交通运输和船舶海洋类专门人才方面具有独特的优势：我校交通行业优势明显。学校依托交通行业背景，不断加强特色学科专业建设，其中道路与铁道工程、载运工具运用工程、桥梁与隧道工程、交通运输规划与管理为省重点学科；交通运输、土木工程专业为国家级特色专业；汽车运用技术、船舶与海洋运输、路面结构与材料实验室为省高校重点实验室；运输车辆检测、诊断与维修技术实验室为全国交通行业重点实验室。高水平的学科、实验室平台可直接为我校申报的两个工程领域的专业学位研究生培养提供有力支撑。我校海洋运输及船舶工业人才培养优势独特。我校是山东省最早开设航海技术、轮机工程、船舶与海洋工程、港口航道与海岸工程等本科专业的高校，取得了国家海事局认证，是省内仅有的两所具有航海与轮机工程本科教育资格的单位之一。2009年，省政府批准我校为山东省船舶与海洋工程专业人才教育培训基地；省教育厅批准我校为山东省首批研究生联合培养基地单位，目前我校已与山东建筑大学、山东科技大学、武汉理工大学联合培养工程硕士研究生。我校长期坚持应用型人才培养，人才培养质量和学生就业率高。2011年荣膺第二届“全国毕业生就业典型经验高校50强”，在教育部对全国80余所高校毕业生就业情况的调查结果中，用人单位对我校毕业生的满意度位列第一。我校在“双师型”教师队伍建设、实践教学环境建设、“产学研合作”人才培养模式等方面积累的应用型人才培养经验和优势，为硕士专业学位研究生培养打下了良好基础。